门源历史悠久。多处出现的卡约文化、辛店文化古村落、古墓遗址说明，早在3000年前，在这块土地上就有古老的羌、戎等先民繁衍生息，从事以牧业、狩猎为主的生活。

　　门源在秦代为羌人故地，两汉、三国为西平郡辖地，东晋十六国时，先后属前凉、后凉、南凉、北凉五国属地，南北朝时为鲜卑族吐谷浑人牧地。隋、唐属鄯州辖地，后被吐蕃占领。宋时为凉州吐蕃六谷部、西夏、河湟吐蕃唃厮啰等地方政权和宋王朝交替统治。元代为章吉附马封地，属西宁州管辖。随同蒙古军队东来的部分"西域亲军"，屯耕牧养留居门源。明代归西宁卫控制，明朝洪武六年(公元1373年)，马步驻军实行"上马为军、下马从耕"，开始从事种植业生产。明末为蒙古族麦力干牧地。清雍正二年(公元1724年)，清军平定罗卜藏丹津反清事件后，置大通卫。次年筑大通城(今门源县城)，乾隆九年(公元1744年)，移大通卫于今大通有到城关镇。1761年，改卫为县，门源系大通县属红山、永安两堡。民国18年农历七月十三日(1929年8月17日)，由大通县划出北大通的红山堡、永安堡和祁连八宝、阿力克一带，西宁县划出仙米寺、珠固寺属一带地方，设置门源县，属青海省管辖。1949年9月10日，门源解放，9月16日，成立门源县人民政府，1953年12月19日，建立民族区域自治政权----门源回族自治区，1955年6月改名为门源回族自治县。

　　人民政权的建立

　　1949年9月10日，中国人民解放军第一野战军一军一师二团在张星垣团长的率领下，和平解放门源。9月16日，中国共产党门源县委、门源县人民政府成立，郭力中任县委书记，县长，翟鸿儒任副书记、副县长。9月20日，建立浩门镇、阴田、孔家庄三个区政府。县、区召集民主人士、旧职人员等召开座谈会，宣传党的政策，稳定社会秩序，开展乡、村一级政权建设，收缴散兵马匹、枪支、弹药。12月5日国民党残余势力在卡子沟首先发动叛乱，12月7日攻陷县城，二区区长张二小、副县长翟鸿儒等49名同志在与匪徒作战中先后英勇牺牲。12月21日解放军一军三师部队击溃判匪，收复县城，平息匪乱。12月22日，青海省委、省军政委员会派遣一批干部对门源县各级党政领导班子进行调整，设立秘书室、财政科、教育科、公安局、建设科。同时门源县人民政府发出"防匪自卫工作"指示，各区、乡召开群众会会议，讲解党的政策，揭露政治谣言，检举匪特活动。1950年1月成立县人民武装部及4个区武装部，相继组建各区武装自卫队，成立门源县人民法院、税务局。3月28日召开门源县第一次各族各界人民代表会议，会议商讨贯彻落实民族团结政策、剿匪肃特、社会治安、生产、教育和政权建设等工作决议，选举产生常务委员会委员，成立各族人民代表大会常务委员会。6月成立门源有到青年团工作委员会。7月召开门源县首届各族农民代表大会，选举成立门源县各族农民协会，同月召开门源县首届各族各界妇女代表大会，同月成立门源县人民检察署。8月11日，省人民政府决定祁连设治局划归门源县管辖。同年，门源县人民政府在全县组织人民自卫队，发展自卫队员556名，年底，成立中国共产党门源县纪律检查委员会，1951年开展了镇压反革命运动，对国民党"西北革命委员会"、"西北反共救国军华正大队"等政治土匪首要分子进行镇压，并取缔一贯道等反动会道门组织。公安部门对反动党、团、军、警、宪、特人员进行登记。5月起是，全县掀起轰轰烈烈的"抗美援朝，保家卫国"活动，举行盛大的抗美援朝示威游行，各族人民群众捐献人民币345135600多元(旧币)、白洋3689元、白银1042两、黄金6两6钱，还有马匹等其它物资。10月始，全县范围内展开了减租反霸斗争。